СЕРВІС «ПЛР-ДІАГНОСТИКА НАСІННЄВОГО І РОСЛИННОГО МАТЕРІАЛУ»
Полімеразна ланцюгова реакція (ПЛР) ― сучасний молекулярно-біологічний метод, який завдяки своїй високій чутливості й специфіці дозволяє встановити поодинокі копії геномів патогенів і одночасно визначає їх наявність тоді, коли іншими методами (імунологічними, бактеріологічними, мікроскопічними) це зробити майже неможливо. Метод ПЛР-аналізу дозволяє проводити ранню діагностику фітопатогенних мікроорганізмів основних сільськогосподарських культур ще до появи їх видимих симптомів у полі та безпосередньо доводить присутність збудника інфекції, специфічно визначаючи наявність конкретної послідовності нуклеїнової кислоти (ДНК або РНК) виявленого патогена.
ПЕРЕВАГИ МЕТОДУ
СЕРВІС ПЕРЕДБАЧАЄ
Сільськогосподарські культури | Етіологія хвороби | Збудники |
ЗЕРНОВІ ЗЛАКОВІ | Грибні хвороби | Фузаріози (F. graminearum, F. сulmorum, F. sporotrichioides, F. langsethiae, F. poae, F. avenaceum, F. tricinctum, F. cerealis, F. verticillioides, F. oxysporum, F. subglutinans, F. proliferatum) Ризоктоніози (Rhizoctonia solani, R. cerealis) |
КУКУРУДЗА | Грибні хвороби | Летюча сажка кукурудзи (Sorosporium reilianum) |
СОНЯШНИК | Грибні хвороби | Фомопсис (Diaporte helianthi) Сіра гниль (Botrytis cinerea) |
ТОМАТИ | Бактеріальні хвороби | Чорна бактеріальна плямистість (Xanthomonas euvesicatoria) Некроз серцевини стебла (Pseudomonas corrugata) Бактеріальний рак томатів (Clavibacter michiganensis subsp. мichiganensis) |
ПЛОДОВІ | Бактеріальні хвороби | Бактеріальний опік плодових (Erwinia amilovora) |
КАРТОПЛЯ | Вірусні хвороби | L – вірус картоплі (Potato Leafroll Polerovirus. PLRV) X – вірус картоплі (Potato X Potexvirus. PVX) Y – вірус картоплі (Potato Y Potyvirus. PVY) M-вірус картоплі (Potato M Carlavirus. PVM) S- вірус картоплі (Potato S Carlavirus. PVS) |
СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКІ КУЛЬТУРИ | Фітоплазмова інфекція | Candidatus Phytoplasma |
○ Пробопідготовка. Механічне подрібнення зразка та гомогенізація до однорідної маси
○ Виділення ДНК
○ Проведення реакції ампліфікації та детекція результатів
При відборі зразків рослинного матеріалу слід ретельно оглянути поле з метою визначити наявність відхилень від нормально розвинутих рослин. Рекомендовано зробити знімок досліджуваної місцевості або занотувати дані, отриману інформацію разом із відібраною пробою передати до діагностичного центру.
З одного поля в десяти різних місцях слід відібрати по 3–5 рослин (кількість точкових проб може змінюватися в залежності від розмірів поля та наявних відхилень) — всього 30–50 шт. Середня проба має містити рослини з нормальним розвитком і уражені/недорозвинуті.
Щоб забезпечити рослинам оптимальні умови при транспортуванні, необхідно у прикореневому шарі лишити не менше ніж 100 г ґрунту*. Якщо рослини великі за розміром — слід відокремити уражені й не уражені
органи (корені, стебла, листя, квітки і плоди). Відібраний матеріал необхідно упакувати в пакети/коробки, що захищатимуть рослини від найменших пошкоджень при транспортуванні.
До пакетa додати форму, в якій обов’язковими для заповнення є наступні поля:
• назва та місцезнаходження господарства;
• культура;
• сорт;
• попередник;
• внесені пестициди;
• відповідальна особа за відбір проб та її контакти;
• iм'я та контакти менеджера з продажів.
* Рекомендовано прикореневу частину рослини запакувати у поліетиленовий пакет iз вкладеним зволоженим ватним тампоном.
Схема відбору середньої проби рослинного матеріалу
