СЕРВІС «ПЛР-ДІАГНОСТИКА НАСІННЄВОГО І РОСЛИННОГО МАТЕРІАЛУ»
Полімеразна ланцюгова реакція (ПЛР) ― сучасний молекулярно-біологічний метод, який завдяки своїй високій чутливості й специфіці дозволяє встановити поодинокі копії геномів патогенів і одночасно визначає їх наявність тоді, коли іншими методами (імунологічними, бактеріологічними, мікроскопічними) це зробити майже неможливо. Метод ПЛР-аналізу дозволяє проводити ранню діагностику фітопатогенних мікроорганізмів основних сільськогосподарських культур ще до появи їх видимих симптомів у полі та безпосередньо доводить присутність збудника інфекції, специфічно визначаючи наявність конкретної послідовності нуклеїнової кислоти (ДНК або РНК) виявленого патогена.
ПЕРЕВАГИ МЕТОДУ
Виявлення латентних (форм мікроорганізмів, які існують приховано) інфекцій ще до появи видимих симптомів
Ідентифікація токсиногенних грибів роду Fusarium
Визначення бактеріальних і вірусних захворювань, що важко діагностуються традиційними методами
Специфічність і висока чутливість методу
Швидке отримання результатів — 2–3 доби
СЕРВІС ПЕРЕДБАЧАЄ
Діагностику інфекційних хвороб основних сільськогосподарських культур та ідентифікацію токсиногенних грибів, що проводяться за допомогою методу полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР).
ЗБУДНИКИ ХВОРОБ, ЯКІ ДІАГНОСТУЮТЬСЯ ЗА ДОПОМОГОЮ ПЛР-АНАЛІЗУ
Сільськогосподарські культури | Етіологія хвороби | Збудники |
ЗЕРНОВІ ЗЛАКОВІ |
Грибні хвороби | Фузаріози (F. graminearum, F. сulmorum, F. sporotrichioides, F. langsethiae, F. poae, F. avenaceum, F. tricinctum, F. cerealis, F. verticillioides, F. oxysporum, F. subglutinans, F. proliferatum) Ризоктоніози (Rhizoctonia solani, R. cerealis) |
КУКУРУДЗА | Грибні хвороби | Летюча сажка кукурудзи (Sorosporium reilianum) |
СОНЯШНИК | Грибні хвороби | Фомопсис (Diaporte helianthi) Сіра гниль (Botrytis cinerea) |
ТОМАТИ |
Бактеріальні хвороби | Чорна бактеріальна плямистість (Xanthomonas euvesicatoria) Некроз серцевини стебла (Pseudomonas corrugata) Бактеріальний рак томатів (Clavibacter michiganensis subsp. мichiganensis) |
ПЛОДОВІ
| Бактеріальні хвороби | Бактеріальний опік плодових (Erwinia amilovora) |
КАРТОПЛЯ |
Вірусні хвороби | L – вірус картоплі (Potato Leafroll Polerovirus. PLRV) X – вірус картоплі (Potato X Potexvirus. PVX) Y – вірус картоплі (Potato Y Potyvirus. PVY) M-вірус картоплі (Potato M Carlavirus. PVM) S- вірус картоплі (Potato S Carlavirus. PVS) |
СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКІ КУЛЬТУРИ | Фітоплазмова інфекція | Candidatus Phytoplasma |
○ Пробопідготовка. Механічне подрібнення зразка та гомогенізація до однорідної маси
○ Виділення ДНК
○ Проведення реакції ампліфікації та детекція результатів
Відбір зразків рослинного матеріалу
При відборі зразків рослинного матеріалу слід ретельно оглянути поле з метою визначити наявність відхилень від нормально розвинутих рослин. Рекомендовано зробити знімок досліджуваної місцевості або занотувати дані, отриману інформацію разом із відібраною пробою передати до діагностичного центру.
З одного поля в десяти різних місцях слід відібрати по 3–5 рослин (кількість точкових проб може змінюватися в залежності від розмірів поля та наявних відхилень) — всього 30–50 шт. Середня проба має містити рослини з нормальним розвитком і уражені/недорозвинуті.
Щоб забезпечити рослинам оптимальні умови при транспортуванні, необхідно у прикореневому шарі лишити не менше ніж 100 г ґрунту*. Якщо рослини великі за розміром — слід відокремити уражені й не уражені
органи (корені, стебла, листя, квітки і плоди). Відібраний матеріал необхідно упакувати в пакети/коробки, що захищатимуть рослини від найменших пошкоджень при транспортуванні.
До пакетa додати форму, в якій обов’язковими для заповнення є наступні поля:
• назва та місцезнаходження господарства;
• культура;
• сорт;
• попередник;
• внесені пестициди;
• відповідальна особа за відбір проб та її контакти;
• iм'я та контакти менеджера з продажів.
* Рекомендовано прикореневу частину рослини запакувати у поліетиленовий пакет iз вкладеним зволоженим ватним тампоном.
Схема відбору середньої проби рослинного матеріалу
